无菌室一般为4 — 5 平方米、高 2.5 米的独立小房间（与外间隔离），专辟于微生物实验室内，可以用板材和玻璃建造。无菌室外要设一个缓冲间，错开门向，以免气流带进杂菌。无菌室和缓冲间都必须密闭、室内装备的换气设备必须有空气过滤装置。无菌室在业内也叫：洁净室、GMP实验室。

无菌室装修规范：
1.二级及三级无菌室符合中华人民共和国卫生行业标准:WS233-2002 《微生物和生物医学实验室生物安全通用准则》。
2. 二级（P2）无菌室为万级、局部百级，符合目前世界通用的美国联邦209E标准。
二级无菌室包含高、中、初效过滤系统，小型中央空调系统，层流送风，井式回风。更衣间及风淋室采用人体自动感应系统。
3.各系统技术指标如下：更衣间及操作间送风口风速≥0.3米/秒,风淋室风速≥15米/秒,操作间与环境静压差≥5Pa,系统噪声≤60dB.
4.三级（p3）无菌实验室除具有二级无菌室的特点外,还专门设立了电子互锁门、传递窗门互锁、环氧树脂自流平地面、下水消毒设施。配置二级生物安全柜，实验室及缓冲间均为负压空间，实验间的相对压强为-30Pa—-40Pa，缓冲间的相对压强为-15Pa—-20Pa。
无菌室装修技术要求：
1.工作室应矮小、平整，高2.2—2.3米，内部装修应平整、光滑，无凹凸不平或棱角等，四壁及屋顶应用不透水之材质，便于擦洗及杀菌。

2.室内采光面积大，从室外应能看到室内情况。
3.为保证无菌室的洁净，无菌室周围需设缓冲走廊，走廊旁再设缓冲间，其面积可小于无菌室。
4.无菌室、缓冲走廊及缓冲间均设有日光灯及供消毒空气用紫外灯，杀菌紫外灯离工作台以1米为宜 ，其电源开关均应设在室外。
5.无菌室与缓冲间进出口应设拉门，门与窗平齐，门缝要封紧，两门应错开，以免空气对流造成污染。